水系統包括冷源設施、冷水輸送設備、排放冷凝水設備及水系統控制設備四部分。

1)冷源設施

風機盤管和總新風系統都是非獨立式的空調器，冷凍水流經盤管換熱器，從而實現對空氣的冷卻、除濕處理。因此，中央空調系統必須有能夠生產冷凍水的冷源設備，如冷水機組。冷源設備通常集中設置在專用的空調機房內。

2)冷水輸送設備

冷水機組生產的冷凍水，必須經水泵加壓后，通過供水管道送到風機盤管和總新風系統。流經各種非獨立式空調機換熱器盤管的冷凍水，在對空氣進行完冷卻除濕處理之后，溫度將升高，再通過回水管道流回冷水機組，以重新被冷卻降溫，使冷凍水可以循環利用，并減少能耗。因此，需要通過供回水管道將冷水機組、循環水泵、非獨立式空調機等設備串接組成閉式冷水循環系統。

對于作分區處理的大型中央空調系統，常在中央機房內設置有分水器和集水器，冷凍水先流至分水器，再經過各個分區的供水干管送出?？照{機的回水則經過各個分區的回水干管流至集水器，再從集水器流回冷水機組。

為了應對水溫變化所導致的水體積變化，通常在中央空調系統的最高處設置膨脹水箱，并與冷凍水閉式循環系統相連通。同時還可以起到向系統補水的作用。

3)排放冷凝水設備

通常風機盤管和新風機都工作在濕工況下，所以表冷器表面都會有凝結水產生。需要在接水盤處連接坡度向下的冷凝水管，以便及時將冷凝水排至下水管。

4)水系統控制設備

水系統的控制，主要是針對冷凍水流量。在中央空調系統末端房間的風機盤管處，設有冷凍水閥，用于調節該房間盤管內的冷凍水流量。每個樓層均設置有電動水閥，用于調節各個樓層冷凍水的總流量。系統的分水器和集水器之間通常會設置一個旁通管，其上安裝有壓差電動調節閥。當空調負荷減小時，壓差電動調節閥在供回水壓差的作用下開啟，使得部分冷凍水經旁通管流回冷水機組，從而在保證冷水機組中冷凍水流量穩定的同時，降低了供給房間的冷凍水流量。